小产权房的法律、质量问题是纠纷焦点。
目前深圳市面上的小产权房没有房产证，绝大多数用一纸协议代替，交易转让存在很大风险。转手时，交易双方去村委过户。而普通公司或个人所建楼的转手，则是以一份新合同，加律师见证为据。
在大多数消费者看来，村委牵头建设的房产风险相对低点，共同出资建房协议书上有律师见证证明之外，有当地村委会盖章。小产权房二手交易的核心证明也是村委会盖章，交易双方可以去村委会过户。
据二手房房地产律师张茂荣介绍，购买小产权房的根本弊端在于产权不确权，不受法律保护，因而不能上市交易，无法办理抵押，无法在国家征地拆迁时获取合法补偿，无法办理继承。广东圣方律师事务所律师颜宇丹告诉记者，小产权房的买卖纠纷主要体现在政府拆迁后的赔偿问题。据知情人士向其透露，在深圳，原来法院是不受理这类案件的，而如买房若就此问题起诉卖方，如今法院的处理方式是：要求卖方返还买方购房款，其余房屋增值部分一概不支持。颜宇丹提醒，由于小产权房不受法律保护，出了问题可能索赔无门，建议购房者谨慎决策。
针对律师是否可以给小产权房的买卖作见证的问题，颜宇丹则表示，这是违规行为，“律协几年前就出台了相关文件，严禁律师给非法买卖交易做公证，一旦被查出，律师负有连带责任”。
